三阴交穴，亦为“血穴”，血为神志活动的物质基础，又因血为肝所藏，脾所统，肾中之精所化，所以对肝、脾、肾均可调理，又因心具有主血脉的生理功能，所以心具有主神志的功能，正如《灵枢经》所言：“血者，神气也”。故灸三阴交在临床上不仅具有防治生殖泌尿系统疾病，心血管疾病的作用，同时，也是调治青少年神经系统的主穴。多用于失眠、健忘、心烦、多梦、神经紧张和神经衰弱等，临床治疗时多与内关、神门、足临泣配合使用。

现代医学对灸足三里进行了相关研究。认为在对血液成分的影响上对血细胞均有向正常范围方面调整作用，对血糖也有良性调整作用；同时，在对三期高血压病合并脑血栓形成恢复期的患者，施足三里灸后，有降低血液凝集的作用，可预防脑血栓的再次发生。若施用瘢痕灸后除血压显著下降外，对改善血液粘度和扩张血管有一定作用，既降低血压，也减少中风发生的概率。对心率和血压有向正常范围调整的作用。对呼吸系统可使通气量、肺活量和耗氧量增加。灸足三里有消炎作用和提高白细胞的吞噬能力，对各种特异性抗体和非特异性抗体，都具有加速生成和提高免疫效价的作用。对消化系统，使各种消化酶含量显著提高，可用于防治胃肠虚弱，消化功能低下，食欲不振，腹泻，肝功能不正常，急慢性胃炎等。